污水处理净化车作业分为三步：固液分离——药物分析——粪便分类。所有抽上来的粪水，首先要通过机器进行固液分离，把固体垃圾如石块、纸巾、塑料袋等杂志分离出去，产生粗渣，这些粗渣当作生活废弃物处理；固液分离之后要进一步处理，在药物分析系统，将粪水搅拌与药物相结合，达到絮凝、除臭。
污水处理净化车可谓一辆高效率移动污物处理工厂，它先利用真空泵将化粪池内混合物抽到固废分离器中，再将混合物中的塑料袋、石块、金属等杂物分离压缩到杂物仓里，污水悬浊物则被送到车顶的储存池中搅拌并送入化学处理池，净化原料调配池中的净化原料将自动投放至化学处理池中，经过药物处理净化后，再送到车尾的固液分离器进行分离，分离后的水能达到国家三类水质标准可以直接排放，分离出的有机肥原材料无异味、无毒害，在车尾排出。
